Perfilado de sección

  • Información General

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    En el primer cuatrimestre del 2026 se dictará:

    • "Taller de Bioinformática"  
    • Electiva "Determinación de secuencia genómica, ensamblado y anotación de fagos (SEA-PHAGES Fase II)" Es parte del programa SEA-PHAGES pero está abierta para incorporarlo a su plan de tesina! (con cupos)

    Quien quiera cursar el "Taller de Bioinformática" como electiva (sólo plan 2007/8 de LB) debe enviar un mail indicandolo a mespariz@fbioyf.unr.edu.ar.

    Quien quiera cursar SEAPHAGES2 sin haber cursado la primera parte debe enviar un mail indicándolo a mespariz@fbioyf.unr.edu.ar.

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    Como transparente virtual se utilizará la plataforma de:

    Taller, Bioinformática:  COMUNIDADES

    Electiva SEA-PHAGES2: EdVFCByF

    No recomendamos cursar el Taller de Bioinformática o la electiva "Bioinformática" si no se tiene las correlatividades para hacerlo. De cualquier forma, pueden contactarse para comunicar su situación particular y tomar una decisión. Toda decisión dependerá, en última medida, de la cantidad de lugares disponibles (¡los cursos son prácticos!)

  • Primer cuatrimestre (2026)

      Horario:

    Taller de Bioinformática:
    • Martes de 08:00 a 10:00 (Comisión 3-4)
    • Martes de 10:30 a 12:30 (Comisión 1-2)
    • Martes de 15:00 a 17:00 (Comisión 7-8)
    • Martes de 17:00 a 19:00 (Comisión 5-6)
    SEA-PHAGESII: 
    • Martes y jueves
    • 13:00 a 15:00
    • AULA 7 (1er piso de la facultad)
    •  

    Inscripción: vía Guararní

    Comenzamos el 26 de marzo!

  • Temario (Taller de Bioinformática)

    Unidad 1: Introducción a la Bioinformática
    Introducción y reseña histórica de la Bioinformática. El rol de la bioinformática en el análisis de datos de expresión génica. La aplicación de la bioinformática en el mapeo gen / genoma. Papel de la bioinformática en la alineación de secuencias y la búsqueda de homólogos. Alcances de la bioinformática estructural. Procesamiento bioinformático de datos de producción masiva (“Big Data”).

    Unidad 2: Búsqueda y comparación de secuencias
    Comparación de secuencias. Secuencias homólogas (ortólogas, parálogas, xenólogas). Bases de datos primarias de ADN y proteínas (GenBank, EMBL, Swiss-Prot, TrEMBL, etc.). Búsquedas en bases de datos por similitud de secuencia utilizando la herramienta BLAST y sus variantes. Bidireccional best Hits. Búsquedas y funcionamiento de las Bases de datos a través de índices y campos. Significancia estadística de la alineación de secuencias.

    Unidad 3: Identificación y búsqueda de motivos locales conservados
    Identificación de motivos y dominios en la alineación de secuencias múltiples: motivos, patrones, reglas, huellas dactilares, bloques, perfiles, modelos de Markov ocultos. PSI-BLAST, PHI-BLAST, Mega-Blast, hmmscan, hmmsearch y jackhmmer. Bases de datos secundarias Pfam, Gene-Ontology, UniProt, PRINTS, ProSIte. Anotación de secuencias.

    Unidad 4: Análisis filogenético molecular
    Tipos de alineamiento: alineamiento global, alineamiento parcial. Alineamiento de a pares y múltiple. Nociones de algoritmos, complejidad y heurísticas. Generación de Matrices de score (BLOSUM, PAM). Dot-Plot. Relación del análisis filogenético con la alineación de secuencias. El concepto de árboles evolutivos. Modelos de sustitución. Análisis filogenéticos basados en caracteres (método de parsimonia y máxima verosimilitud) y en distancia (método de unión de vecinos “Neighbor-Joining” y UPGMA). Fiabilidad de las predicciones filogenéticas: Bootstrap y Jackknife. Complejidad del genoma y análisis filogenético.

    Unidad 5: Bioinformática Estructural
    Análisis bioinformático de estructuras, alineamiento estructural. Archivos PDB. Bases de datos estructurales. Búsqueda de motivos estructurales. Predicción de la estructura terciaria de proteínas y complejos proteína-ácidos nucleicos (AlphaFold3). Programas para la visualización de estructuras 3D (PyMOL).

    Unidad 6: Análisis Bioinformático de Genomas
    Ensamblado y anotación de genomas, predicción de genes. Base de datos de Genomas. Mapeo físico de genes. Variantes alélicas “Variant Calling”. Uso de Genome Browsers (NCBI), RAST, Ensembl y Galaxy. Comparación de Genomas. Identidad nucleotídica promedio. Genómica comparative en eucariotas. Tamaño del genoma eucariota y tipos de secuencias. Estructura génica, alelos, ploidía. Bases de datos de genomas eucariotas. Marcadores moleculares y polimorfismos. Diversidad nucleotídica. Cambios sinónimos, no sinónimos y silenciosos. Análisis de los gráficos de sintenia.

    Unidad 7: Técnicas "ómicas"
    Producción y análisis de grandes datos. Conceptos de genómica, transcriptómica, proteómica, y metabolómica. Secuenciación ADN/ARN, MicroArrrays, generación de datos de proteínas y metabolitos mediante técnicas de espectrometría de masa. Integración y visualización de resultados de técnicas ómicas. Bases de datos de vías metabólicas KEGG, BioCyc y otras. Análisis multivariado: Análisis de componentes principales (PCA). Nociones matemáticas generales de la determinación de las componentes: eigenvalues, eigenvectors y loadings. Análisis de conglomerados jerárquicos y de partición. Mapas de calor (heatmaps) y volcano-plots. Análisis e interpretación de resultados de ómicas utilizando análisis multivariado.

  • Oferta de Posgrado

    Actualización de la oferta de posgrado del Área de Bioinformática

    A partir del segundo cuatrimestre, el curso de posgrado “Aspectos Esenciales de Bioinformática” dejará de ofrecerse como parte de la propuesta del Área de Bioinformática de la Facultad.

    En su lugar, la oferta se reorganiza en dos cursos independientes, con el objetivo de adecuar los contenidos a distintos niveles de formación y perfiles de estudiantes:

    • Fundamentos de Bioinformática
      Curso presencial, con fuerte énfasis práctico, orientado a graduados de carreras de las áreas biológicas sin formación previa en bioinformática. Brinda una introducción a las herramientas y conceptos básicos necesarios para el uso de recursos bioinformáticos en investigación y práctica profesional.

    • Bioinformática aplicada a las ómicas: del análisis a la interpretación
      Curso dirigido a estudiantes y profesionales que ya cuentan con conocimientos básicos de bioinformática y desean profundizar en el análisis e interpretación de datos ómicos (genómica, transcriptómica, proteómica y metabolómica). Incluye una introducción a metodologías de frontera como las ómicas de célula única y la participación de docentes e investigadores activos en estas áreas.

    Ambos cursos se dictarán durante el segundo cuatrimestre. Esta reorganización busca ofrecer trayectorias formativas más adecuadas a las necesidades y niveles de formación de los distintos perfiles de estudiantes interesados en bioinformática aplicada.

    Estos cursos fueron elevados a la Secretaría de Posgrado y se encuentran actualmente en proceso de evaluación por el Consejo Directivo. Por este motivo, aún no están habilitados para la inscripción.